Etter hvert som Europa gikk inn i etterkrigstiden, ble Santiago Bernabeu klubbpresident. Klubbens stadion og treningsanlegg ble gjenoppbygget etter skadene som oppstod under både borgerkrigen og andre verdenskrig. På 1950-tallet lanserte Real et ungdomsakademi, i tillegg til at klubben signerte spillere i verdensklasse. Den mest fremtredende av disse var argentinske Alfredo di Stefano.

European Cup ble lansert i 1955, turneringen vi i dag kjenner som Champions League. Under Bernabeus veiledning etablerte Real seg som en av de største utfordrerne i denne konkurransen. Mellom 1956 og 1960 vant klubben troféet fem ganger på rad! Etter disse fortløpende seierne ble Real permanent tildelt det europeiske cup-troféet, og fikk retten til å bære UEFA-æresmerket.

I 1966 vant Real Madrid European Cup for sjette gang, da de slo de jugoslaviske mesterne Partisan Belgrade 2-1 i finalen. På den tiden besto Reals lag av spillere med samme nasjonalitet, i motsetning til dagens tropp. Laget ble kjent av