Erik 14.s behov for en havn i vest økte dramatisk med Älvsborgs fall. Nå ville den enkleste måten å skaffe seg dette på være ved å erobre Trondheim. Jämtland og Härjedalen, denne utstikkeren fra det norske territoriet inn i Sverige, var vanskelig for nordmennene å forsvare, og ble erobret uten særlig motstand allerede høsten 1563. Frederik 2. beordret at området skulle gjenerobres, og Ebert Bild, kommandanten på Steinviksholm festning ved Trondheim, sendte av gårde et par hundre mann. Området ble raskt tatt tilbake. For å slippe byrden med underhold av Ebert Bilds soldater ville innbyggerne i Jämtland og Härjedalen selv forsvare seg mot svenskene. Befolkningen her følte seg nok vel så svensk som norsk da den var underlagt Danmark-Norge som land, men geistlig sett underlagt den svenske kirken.
Frederik 2. tok Älvsborg festning i 1563. Dette var den eneste havnen Erik 14. hadde mot vest, og tapet skulle gi store ringvirkninger i resten av Norden.