teori tok form. Men Darwin kom ikke til noen spennende eller helt avgjørende konklusjoner før mye senere.
Han var i posisjon til å få tak i nylig publiserte teorier, for eksempel Charles Lyells «Geologiens prinsipper», og de hadde stor innvirkning på Darwins tenkning. Han gjorde funderinger rundt de lange, saktegå-ende prosessene i naturen, som kan komme til syne etter svært lange tidsperioder. Han oppdaget også at han ikke var særlig sjøsterk. Han var plaget av sjøsyke under hele reisen, noe som skulle bli starten på et liv med mye sykdom for Darwin.
Teoriene begynner å ta form
Årene etter turen med Beagle viste seg å bli en fruktbar tid for å tenke og utvikle idéer for Darwin. Med en generøs katalog av artseksemplarer knyttet til sitt navn, besøkte Darwin mange akademikere og biologer for å dele funnene fra sine reiser. Etter å ha fulgt i sin bestefars fotspor, gikk Darwin dypt inn i vurderinger rundt emnet transmutasjon og kunne se nøyaktig hvordan det kunne være mulig. Darwin forsto at dyr som var tilpasset sitt miljø kunne overleve lengre og ha flere avkom, og dermed garantere artens overlevelse over tid. Han kalte dette «Natural Selection», eller naturlig seleksjon.
Med dette gjennombruddet skaffet Darwin seg selv problemer. Han var en kristen som hadde studert guddommelighet - hvordan kunne denne ideen, som motsatte seg det kristne synet på verden, være riktig? Han hadde også sett hvordan hans egen bestefar hadde blitt behandlet for å ha utforsket sine tanker om transmutasjon, og fryktet det samme kunne skje med ham. Darwin bestemte seg for å gå videre med forsiktighet og fortsatte å samle bevis for å støtte sin teori. I stedet publiserte han en redegjørelse av sin tid på The Beagle.