Napoléon Bonapart døde på St.Helena 5.mai 1821.

Napoléons helse ble verre, og i 1817 fikk man mistanke om magesår eller magekreft, det samme som hadde tatt livet av faren. I begynnelsen av 1821 var han sengeliggende og ble dårligere dag for dag. Som et siste ønske ville han at asken skulle spres ved elven Seinens bredder; «Blant det franske folk som jeg har elsket så høyt», som han skrev i dagboken. Hans siste ord var: Frankrike, hæren, hærføreren, Joséphine.

Napoléon Bonaparte døde 5. mai 1821, 51 år gammel. Levningene kom ikke hjem til Paris før i 1840 og i 1861 ble han gravlagt i en likkiste av stein, under kuppelen på Les Invalides.

Hans siste hvilested er en enorm sarkofag i Invalidedomen i Paris.